上海轨道交通崇明线主线全长48.363km，起于浦东新区广兰路站，终至崇明区裕安站，远期将延伸至启东市。共设10座车站，平均站间距5.373km。
横沙支线独立运营，需下车换乘，全长约13.65km，设3座车站，平均站间距6.823km。
崇明线一二期同步开通，在一、二期工程线路中：
金吉路站换乘9号线（松江南站-曹路火车站）；
申江路站换乘12号线（洞泾-金海路）；
长兴岛站换乘崇明线横沙支线（长兴岛-横沙）。
崇明线南延伸崇明线南延伸工程（该规划仅存在于论文中，暂未被采纳）起于金吉路站，终至广兰路站，设2座车站：
金粤路站换乘13号线（芳乐路-台儿庄路）、14号线（安亭北站-桂桥路）；
广兰路站换乘2号线（蟠祥路-浦东机场南）、21号线（吴淞-浦东机场南）。
崇明线主线
崇明线横沙支线崇明线主线将开设大站车，大站车仅停靠广兰路、金吉路、申江路、长兴岛、陈家镇、裕安、圆陀角（启东）站。
